Nazwa topograficzna Chojnik pochodzi od drzew iglastych - choinek. Niemiecka nazwa podawana w źródłach to Hoing.
W XVI wieku miejscowość ta nazywała się Gogow i wtedy też należała do królewskich dóbr międzyborskich.

W późniejszym czasie wydzierżawiona została Hansowi Domizigowi. Po 1635 r. była we władaniu książęcym, w posiadaniu Jana Dietfelda von Dietmansdorfa.
W XVIII i XIX w. przynależała do dóbr Międzybórz, a po śmierci księcia Brunszwicko - Oleśnickiego Wilhelma w 1884 r. przeszła w ręce króla Saksońskiego Alberta.
W latach osiemdziesiątych XIX w. majątek Chojnik z folwarkiem Sobke wydzierżawił Ryszard Hoffman. Po podziale dóbr międzyborskich w roku 1885 część Chojnika z folwarkiem Sobke oraz przyległymi lasami stała się własnością Richarda v. Buddenbrocka, a następnie jego spadkobierców. W roku 1905 Chojnik odkupił Martin Biedermann, i odsprzedał Henrykowi Mankowskiemu.
Wkrótce, bo już w 1910 r., majątek Chojnik uległ likwidacji. Około roku 1905 wieś liczyła 697 mieszkańców. W latach osiemdziesiątych XVI w. w Chojniku znajdował się folwark, a także duża kuźnica żelaza, która dostarczała żelaza i szyn na budowę kolei w Międzyborzu.
Zgodnie z zapisami w opracowania D. Bojarczuka w 1785 r. w Chojniku funkcjonowały dwa folwarki i ewangelicka szkoła. Liczba mieszkańców wynosiła wówczas 323 osoby. Liczba ta ciągle wzrastała i w roku 1830 w całej wsi było już 61 domów i 546 mieszkańców.
Zespół folwarkowy, o którym była mowa wcześniej, położony był w centralnej części wsi, po zachodniej części drogi z Międzyborza i rzeki Młyńska Woda. Później uległ on gruntownemu przekształceniu w układzie kompozycyjnym i funkcjonalnym. W roku 1911 zespół folwarczny składał się z dziedzińca gospodarczego, ogrodu i szkoły folwarcznej.
W latach XX wieku w jego północno - zachodniej części został usytuowany zbór ewangelicki a obecnie kościół parafialny pod wezwaniem Chrystusa Króla.
W miejsce stodoły majątkowej w latach 1925 – 1926 wybudowano świątynię, a dom mieszkalny przebudowano w 1930 r. na plebanię. Miejsce budynku służby folwarcznej przy głównym wjeździe zajmował dom starców. Dziewiętnastowieczny budynek inwentarski, który wchodził w skład zabudowań folwarcznych został zaadoptowany na mieszkania, a w okresie powojennym na przedszkole i sale katechetyczną.
Do dnia dzisiejszego na terenie Chojnika znajdują się zabudowania folwarczne, będące we władaniu m.in. parafii (plebania), Katolickiego Stowarzyszenia Młodzieży, gminy (budynek Organistówki) oraz w rękach prywatnych (budynek mieszkalny i stodoła).
Obecnie wieś zamieszkuje 320 osób. Na jej terenie oprócz szkoły podstawowej (klas 1 – 3), przedszkola, trzech sklepów spożywczo-przemysłowych i Wytwórnia Pasz Rolmark prężnie działają organizacje społeczne. Wśród nich na wyróżnienie zasługują: Ochotnicza Straż Pożarna z wieloletnimi tradycjami (rok powstania 1922 r.), Koło Gospodyń Wiejskich oraz Stowarzyszenie na rzecz rozwoju miejscowości Chojnik i Kuźnica Kącka.